Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms