Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms