Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms