Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms