Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX29Q8TEQ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms