Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms