Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ZNF548Q8NEK5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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