Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf106Q8NAJ2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms