Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LTBP4Q8N2S1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBP4Q8N2S1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms