Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNE4Q8N205 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms