Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPAP2Q8IXW5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms