Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms