Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00523Q86TU6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00523Q86TU6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms