Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT28Q7Z3Y7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms