Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms