Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms