Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTF1AQ7RTS3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms