Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13LQ71F56 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms