Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf139Q6ZV77 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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