Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGD6Q6ZV73 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms