Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00173Q6ZV60 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms