Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms