Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPOCD1Q6ZMY3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms