Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A10Q6U841 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms