Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms