Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNNM4Q6P4Q7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM4Q6P4Q7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms