Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASC4Q6P4E1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms