Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3F3CQ6NXT2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms