Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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