Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms