Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms