Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHEQ5VZ18 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms