Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD4Q5VX71 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms