Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHF19Q5T6S3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms