Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL22Q53GT1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms