Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPAT3Q53EU6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPAT3Q53EU6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms