Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PKDCCQ504Y2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms