Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms