Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms