Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSF3Q4G176 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms