Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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