Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TBRG1Q3YBR2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms