Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SP6Q3SY56 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SP6Q3SY56 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms