Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms