Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC96Q2M329 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms