Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms