Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFA9Q16795 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms