Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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