Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYPL1Q16563 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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