Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CRY1Q16526 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRY1Q16526 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CRY1Q16526 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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